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KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒

簡要描述:產(chǎn)品名稱:KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒
產(chǎn)品貨號:KK4960
產(chǎn)品規(guī)格:300反應(yīng)

  • 產(chǎn)品型號:KK4960
  • 廠商性質(zhì):生產(chǎn)廠家
  • 更新時間:2023-07-17
  • 訪  問  量:1333
詳細(xì)介紹
品牌其他品牌供貨周期現(xiàn)貨
應(yīng)用領(lǐng)域醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè)

產(chǎn)品介紹: 

  KAPA hgDNA定量&QC試劑盒,是基于SYBR Green I染料法優(yōu)化的高質(zhì)量qPCR檢測試劑盒,包含KAPA SYBR® FAST qPCR Master Mix預(yù)先稀釋的一系列DNA標(biāo)準(zhǔn)品,以及針對于人類基因組單拷貝的高度保守區(qū)域的不同位點所設(shè)計的引物預(yù)混液。最小片段所對應(yīng)的引物,用于獲得絕對定量的結(jié)果,而額外的引物,用于獲得在DNA樣本中可擴增模板量(質(zhì)量高的核酸片段)的信息。這個試劑盒由此所產(chǎn)生的質(zhì)量分?jǐn)?shù)(即Q-ratios),可以用于預(yù)測文庫的產(chǎn)量,或者對于如FFPE DNA這類樣本質(zhì)量變化很大的樣本的工作流程進行調(diào)整。


產(chǎn)品名稱:KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒

產(chǎn)品貨號:KK4960


產(chǎn)品特點:

在單次檢測中,同時評估樣本量以及樣本質(zhì)量

可以將質(zhì)量分?jǐn)?shù)(Q-ratios)與測序相關(guān)指標(biāo)相關(guān)聯(lián)

高性能的KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix

預(yù)先稀釋好的DNA標(biāo)準(zhǔn)品以及可以直接使用的引物

多功能、易于自動化的工作流程


產(chǎn)品原理:

一組DNA標(biāo)準(zhǔn)品,使用三對不同引物,用于產(chǎn)生(最多)三組標(biāo)準(zhǔn)曲線。這三對引物的擴增目標(biāo),位于某高度保守、單拷貝的人類基因組位點,其大小分別為41 bp, 129 bp以及305 bp。41 bp檢測用于DNA樣品的絕對定量。對于評估DNA質(zhì)量,使用129 bp和/或305 bp引物預(yù)混液生成標(biāo)準(zhǔn)曲線并且檢測樣本。由于低質(zhì)量的DNA樣本的長片段擴增效率會大幅度降低,相對的DNA質(zhì)量可以通過41 bp檢測的濃度,對于129 bp或者305 bp檢測的濃度進行均一化,或者在此DNA樣本中可被擴增的物質(zhì)的量來進行推測。這種通過標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)生的質(zhì)量分?jǐn)?shù)(值介于0和1之間),可以用于指示DNA的質(zhì)量,或者在此DNA樣本中可被擴增的物質(zhì)的量。


產(chǎn)品優(yōu)勢:

對于稀釋后的DNA樣本進行絕對定量

用附加的引物進行定量分析,獲得的Q-ratio用于指示樣本的質(zhì)量1.png

使用預(yù)期:

文庫的轉(zhuǎn)化率,為在Illumina測序平臺上進行靶向重測序而制備

分別從樣本質(zhì)量參差的80-100 ng FFPE DNA樣本(橙色)和商用人類基因組DNA(灰色),使用KAPA LTP文庫構(gòu)建試劑盒來構(gòu)建測序文庫。FFPE DNA樣本在用Covaris打斷之前,用KAPA hgDNA定量&QC試劑盒進行檢測,然后按照Q-ratios(DNA質(zhì)量)沿X軸升序排列。Q-ratios如圖中標(biāo)注。片段化的DNA(平均大小在180 bp左右)在建庫之前,用Qubit® HS dsDNA (Life Technologies) 進行定量;在連接接頭、形成文庫分子之后,使用基于qPCR的KAPA文庫定量試劑盒進行定量。結(jié)果顯示,F(xiàn)FPE樣本的文庫轉(zhuǎn)化率(Conversion Rate,起始DNA分子轉(zhuǎn)化成連接有接頭的文庫分子的百分比,%)明顯低于高質(zhì)量的DNA樣本,使得FFPE樣本的文庫分子多樣性受到限制,并且需要在文庫擴增步驟中采取更多的循環(huán)數(shù)才能得到足夠多的文庫分子進行靶標(biāo)捕獲,從而使FFPE樣本的文庫的重復(fù)率(duplication rate) 更高,靶標(biāo)覆蓋率(target coverage)更低。


產(chǎn)品名稱:KAPA 人類基因組DNA定量及QC試劑盒

產(chǎn)品貨號:KK4960


產(chǎn)品訂購信息

品牌     貨號             名稱                                   規(guī)格

KAPA  KK4960  KAPA hgDNA定量和質(zhì)控試劑盒   300反應(yīng)


關(guān)于公司:

Kapa Biosystems位于美國馬薩諸塞州威爾明頓,是一家蛋白質(zhì)工程專家及基因組學(xué)工具供應(yīng)商,致力于研發(fā)、生產(chǎn)下一代測序(NGS)所需的生物酶及相關(guān)試劑,該公司基于直接分子進化平臺開發(fā)的產(chǎn)品已被廣泛用于DNA擴增、測序、基因組學(xué)研究、分子診斷等領(lǐng)域。


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